图1：GEO主页

点击 Search 后进入搜索结果页面（图2），左侧可以对搜索结果进行进一步过滤， Organism 可以指定物种名称，本次我们选择Homo sapiens；Study type可以指定数据的类型，如基因表达量数据，甲基化数据，基因变异数据等，本次我们选择基因表达量数据“Expression profiling by array”和“Expression profiling by high throughput sequencing”； Author 可以指定数据集的上传作者； Attribute name 可以指定样本为组织或细胞系等类型； Publication dates 指定数据上传的时间范围。点击每个过滤项底部的 Customize .. 对相应的选项进行条件添加，条件显示在数据库后，再次点击该条件，使其显示√，表明目前搜索结果已进行该条件过滤。

图3：GSE237935数据集测序平台和样本信息

图5：分析参数设置

图6：点击按钮开始分析

我们使用Metascape（ http://metascape.org/gp/index.html#/main/step1） ， 对差异表达基因进行富集分析。Metascape是一个在线富集分析的网站，整合了GO、KEGG、UniProt和DrugBank等多个数据库，且操作简便。

图8：Metascape 分析界面

图11：分析结果页面

图12：下载的结果文件