同源重组缺陷（Homologous Recombination Deficiency, HRD ）是DNA 修复 途径缺陷的结果 ，会 造成 基因组 和染色体 的不稳定 。 HRD 阳性 常见于卵巢癌 患者 中，是 卵巢癌 聚腺苷二磷酸核糖聚合酶抑制剂（ PARP in hibit or, PARP i ） 治疗相关的重要 生物标志物 之一 。

MEDx HRDetectCDx 测试通过捕获法靶向测序约 42,000 个特定于中国人群的全基因组单核苷酸多态性（ SNP ），覆盖度 约为 ±200x ，并对 85 个基因的编码外显子进行了约 ±400x 的覆盖度测序。通过分析 LOH 、 TAI 和 LST ，计算 HRD 评分。分值 ≥43 （阈值）时判定 HRD 为阳性。 并 通过与 Myriad my Choice CDx 比较来评估 HRDetectCDx 的分析性能。

1.MEDx-HRDetectsCDx与Myriad test具有高度一致性

HRDetect CDx pan e l 和 myChoice CDx   之间的阳性一致率为 89.5% ，阴性一致率是 93.3% ，总体一 致率是 91 .2% （表 1 ）。

• 227名符合条件的患者入选，122名患者接受了HRDetectCDx测试，其中92名可评估HRD状态。20名患者（16.4%）携带BRCA 突变（BRCA mutation, BRCAm），53名患者（43.4%）HRD阳性（表2）。

• 16.4%（20/122）的患者中发现了胚系与体系 BRCA1/2突变，包括BRCA1的13个突变和BRCA2的7个突变。其中，13名患者显示BRCA1/2突变，且HRD评分大于43（图1）。

• 突变频率较高的基因包BRCA1（14%）、PALB2（9%）、BRCA2（8%）、ARID1A（7%）、PTEN（5%）、BRIP1（4%）和ATRX、FANCL和SLX4（每个基因的突变频率为3%）。特别是当可能致病和不确定意义的变异（variant of uncertain significance, VUS）基因突变被包括在内时， SLX4基因的突变频率高达16%，超过了BRCA1基因的突变频率（15%）（图3）。

图3 ：Gene mutation landscape of the HRDetectCDx panel

• PFS分析显示， 与野生型SLX4 患者相比， SLX4 基因中可能致病或 VUS 突变的患者预后 更 差（图 4A-C ）。 SLX4 基因中的大多数 可能致病和 VUS 突变分布在 其功能 尚未确定的区域（图 4D ）。
  

图4 ：PFS analysis of patients in subgroups with different SLX4 statuses and SLX4 mutation distributions PFS analysis in the SLX4 mutation subgroup (pathogenic and VUS) vs. wild-type subgroup within the HRD cohort (A), the HRP cohort (B), and the whole cohort (C). D, Distribution of detected SLX4 mutations.

迈杰医学  MEDx HRDetectCDx   Panel 适用于检测中国卵巢癌患者 的 HRD 状态 ，其预测无进展生存期的能力也在真实世界研究中 得到了确认， 有效预测了具有不同 BRCA 和 HRD 状态的 卵巢癌 患者的预后。 SLX4 基因 中可能致病或 VUS 的 变异 频率相对较高，这些突变与使用 尼拉帕利 一线维持治疗的 卵巢癌 患者预后较差相关。这些发现 将 促使 进一步研究 ，以便为制定个性化治疗方案和 深入了解 HRD 的分子机理提供新的认识。

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致谢

感谢再鼎医药（上海）有限公司对本研究的支持。